İsrail Ulaştırma Bakanı Miri Regev, Flydubai'nin Dubai-Tel Aviv seferini yapan yolcu uçağının havada acil durum ve kaçırılma ihbarının ardından, şirketin ülkeye yaptığı tüm uçuşların askıya alınmasını istedi. Regev, iç istihbarat teşkilatı Şin Bet'e başvurarak bu kararı aldı. Kararın gerekçe gösterilen ihlale dayanarak, "Bu durum açık bir anlaşma ihlalidir ve Şin Bet konuyu derhal araştırmalıdır" ifadesiyle değerlendirildi. Hava yolu şirketi Flydubai'nin İsrail hava sahasını kullanabilmesi için yapılan anlaşmanın, seferlerde görevli tüm pilotların İsrail ile ilişkilerini normalleştiren ülkelerin vatandaşı olmasını şart koştuğu belirtildi. Umman'ın bu kategoride yer almadığı da kaydedildi.
Haberde, olayın ardından Mossad, Şin Bet, İsrail ordusu ve Ulaştırma Bakanlığı tarafından müşterek bir soruşturma başlatıldığı aktarıldı. Güvenlik birimlerinin, uçuştan önce herhangi bir saldırı istihbaratının bulunup bulunmadığına ve Umman asıllı olduğu öne sürülen yardımcı pilotun uçağı kullanmasına nasıl izin verildiğine odaklandığı kaydedildi. Kanal 12 televizyonu, yolcu uçağını kullanan iki pilotun kavga ettiğini tespit etti. Pilotlardan birinin kavga sırasında bilincini kaybettiği, bu esnada yanlışlıkla acil durum kodu gönderildiği basına yansıdı.
Pilotlardan birinin Ukrayna vatandaşı, diğerinin de Rusya vatandaşı olduğu iddiası basında yer aldı. Pilotlardan birinin intihar etmeye ve uçağı düşürmeye çalıştığı, İsrailli yolcuların da bunu engellemeye çalıştığı iddiasının araştırıldığı da aktarıldı. Tel Aviv'e varmasına 40 dakika kala, Ürdün semalarındayken yerel saatle 09.08'de ilk acil durum kodunu yollayan uçağın pilotları arasındaki kavga nedeniyle 14 bin feette düşüşe geçtiği, ancak ardından toparlanarak Suudi Arabistan'a indiği kaydedildi.
İsrail Başbakanlık Ofisinden yapılan açıklamada olayın uçak kaçırma girişimi olmadığı ifade edildi. Flydubai Üst Yöneticisi (CEO) ise kısa süre içinde Dubai'den Suudi Arabistan'a bir uçak sevk edileceğini ve yolcuların İsrail’e gönderileceğini kaydetti. Kanal 12'ye konuşan üst düzey İsrailli bir yetkili, Tel Aviv'de olayın terör saldırısı olarak değerlendirildiğini ve "büyük bir felaketin son anda önlendiğini" iddia etti.
